Σύμφωνα με τον νέο νόμο για τα ΑΕΙ (Ν.4009/2011, Ν.4076/2012 και 4115/2013), τα όργανα διοίκησης του ΤΕΑΠΗ είναι: ο/η Πρόεδρος και η Συνέλευση. Στο Τμήμα δεν έχουν συσταθεί τομείς.
Η Συνέλευση συγκροτείται από τους καθηγητές και τους υπηρετούντες λέκτορες, έναν εκπρόσωπο των μελών ΕΕΠ, έναν εκπρόσωπο των μελών ΕΤΕΠ, έναν εκπρόσωπο των προπτυχιακών φοιτητών και έναν εκπρόσωπο των μεταπτυχιακών φοιτητών.
Σύμφωνα με τον νέο νόμο για τα ΑΕΙ (Ν.4009/2011, Ν.4076/2012 και 4115/2013), το ΤΕΑΠΗ πρόκειται να ενταχθεί σε Σχολή, στην κοσμητεία της οποίας θα συμμετέχει διά του προέδρου του, στη δε Γενική Συνέλευση της Σχολής θα συμμετέχει διά των καθηγητών και των υπηρετούντων λεκτόρων.
Τα όργανα του Πανεπιστημίου είναι το Συμβούλιο, ο Πρύτανης και η Σύγκλητος. Το ΤΕΑΠΗ θα εκπροσωπείται στη Σύγκλητο μέσω του Κοσμήτορα της Σχολής, στην οποία θα ενταχθεί, και του Προέδρου του.
Για το ακαδημαϊκό έτος 2017-2018 και 2018-2019
Πρόεδρος: Δήμητρα Μακρυνιώτη, Καθηγήτρια Αναπλ. Πρόεδρος: Βασίλειος Τσάφος, Αναπληρωτής Καθηγητής
Μέλη της Συνέλευσης: καθηγητές και υπηρετούντες λέκτορες του Τμήματος, εκλεγμένοι εκπρόσωποι των μελών ΕΕΠ και ΕΤΕΠ, εκλεγμένοι εκπρόσωποι των προπτυχιακών και μεταπτυχιακών φοιτητών.
Τη διοικητική υποστήριξη του Τμήματος έχει η Γραμματεία.
